Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ODC1P11926 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ODC1P11926 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ODC1P11926 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms