Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FAM58BPP0C7Q3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM58BPP0C7Q3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM58BPP0C7Q3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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