Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PKHD1P08F94 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PKHD1P08F94 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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