Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COCHO43405 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COCHO43405 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COCHO43405 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms