Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GSC2O15499 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSC2O15499 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GSC2O15499 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GSC2O15499 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GSC2O15499 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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