Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms