Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PCH4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PCH4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PCH4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PCH4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PCH4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms