Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARID3CA6NKF2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms