Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TNFSF18Q9UNG2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms