Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDH7Q9ULB5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH7Q9ULB5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms