Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms