Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDH22Q9UJ99 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDH22Q9UJ99 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH22Q9UJ99 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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