Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MBD1Q9UIS9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms