Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms