Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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COPS7AQ9UBW8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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