Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SPASTQ9UBP0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPASTQ9UBP0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms