Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CPNE7Q9UBL6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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