Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNMT3BQ9UBC3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms