Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.5 ms