Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTA1Q9NP79 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms