Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3GQ9HC16 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms