Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NYXQ9GZU5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms