Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms