Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC13A1Q9BZW2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 926.2 ms