Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LPIN3Q9BQK8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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