Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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SPOCK3Q9BQ16 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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SPOCK3Q9BQ16 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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SPOCK3Q9BQ16 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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SPOCK3Q9BQ16 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPOCK3Q9BQ16 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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