Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NABP2Q9BQ15 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NABP2Q9BQ15 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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