Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHP1Q99653 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms