Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms