Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRIQ1Q96JM4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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