Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN7L3BQ96GX2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN7L3BQ96GX2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms