Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms