Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms