Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG4Q92954 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms