Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM3CQ92520 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms