Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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