Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLEC4CQ8WTT0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms