Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNE4Q8N205 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNE4Q8N205 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms