Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TCF23Q7RTU1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms