Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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