Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms