Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDRD12Q587J7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms