Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms