Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL38Q2WGJ6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms