Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms