Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms