Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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