Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDKN3Q16667 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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