Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms