Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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PMCHL1Q16048 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PMCHL1Q16048 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PMCHL1Q16048 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL1Q16048 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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